跑步内脏疼可能与剧烈运动、饭后运动、结肠炎、肝炎、阑尾炎等有关，建议先就医检查，明确原因后配合医生进行针对性处理。

1、剧烈运动：如果平时运动量比较少，突然进行剧烈运动，可能导致身体耗氧增多，身体氧气供应不及时，容易导致内脏因缺氧而疼痛。一般无需特殊处理，静坐休息一段时间，等氧气恢复供应后不适症状会逐渐消失。

2、饭后运动：如果刚吃完便开始跑步，胃肠中的内容物过多，胃部扩张，跑步时胃壁会受到牵拉，可能引起疼痛。暂时不需要处理，可以适当按揉脐周，促进消化。刚吃完饭需要多休息，避免立即运动。

3、结肠炎：此病可能与微生物感染、肠道微生态异常等有关，运动可能会诱发此病，患者的下腹部会出现疼痛，伴有腹泻、便血等不适。建议遵医嘱使用甲泼尼龙片、苦参胶囊、盐酸米诺环素胶囊等药物进行治疗，通常可以抑制炎症发展。

4、肝炎：此病通常与饮酒、病毒感染等有关。运动会导致身体能量消耗过多，肝脏负担加重，可能会诱使疾病发作。患者会出现乏力、腹胀、上腹部疼痛等不适。建议遵医嘱使用硫唑嘌呤片、双环醇片、重组人干扰素α2b注射液等药物进行治疗，可以调节免疫、抗病毒。

5、阑尾炎：此病多与阑尾管腔阻塞、细菌入侵等有关，患者在进食、剧烈运动、精神紧张时阑尾可能会出现疼痛，伴有恶心、呕吐等不适。建议患者配合医生进行经胃内镜阑尾切除术，将病变的阑尾直接切除，术后要注意休息。

平时尽量以慢跑、骑自行车等有氧运动为主，避免过于劳累。