慢性腹泻的主要危害之一是会导致肠道菌群失调，可诱发真菌性肠炎、肠出血等多种大肠疾病，严重时可能会导致肠穿孔。同时会因为长期性腹泻而出现免疫力下降的情况，且会因此而发生继发性感染。除此之外，还会引起营养不良和肝肾功能异常。

慢性腹泻一般会导致大便次数明显增多，具有排便次数多且较急的特点，且大便状态也会变得异常，可呈现出大便溏稀、颜色较浅和粪便量少等诸多特征，往往会夹杂有少量粘液或脓血。另外，不少患者可出现发烧腹痛等全身性反应，还会并发营养不良和中毒性肝炎。

小儿的消化系统发育还不是特别的成熟，肠胃功能比较差，如果饮食不当可能会导致慢性腹泻；细菌或病毒感染、着凉、不注意卫生、有乳糖不耐受问题时，也常会有慢性腹泻出现。细菌或病毒感染、着凉等引起肠炎时，还常会伴随着发烧症状。

导致慢性腹泻的原因很多，经常食用生冷油腻的食物，饮食不当对肠胃造成很大负担时，会引起慢性腹泻；精神过度紧张也会导致慢性腹泻症状出现。另外，幽门螺旋杆菌感染，患有肠易激综合征、克罗恩病、肠结核等疾病时，也会引起慢性腹泻。

慢性腹泻并不严重，但因消化道疾病、全身性疾病造成，轻者出现消化道溃疡，严重者造成全身性感染。