不孕与子宫内膜异位互为因果关系，正常妇女不孕率为15％，内异症患者可高达40％，而不孕妇女25％～50％具有子宫内膜异位症的疾患。重度子宫内膜异位症患者不孕可能与解剖结构变化有关，虽然子宫内膜异位症很少侵犯输卵管肌层和黏膜层，但盆腔脏器的广泛粘连，输卵管僵硬影响其正常蠕动，严重病变可致使输卵管伞端闭锁，从而影响卵子的拾取和精子、受精卵的输送从而导致不孕。