慢性腹泻患者可以选择服用具有健脾止泻作用的一些中药方剂进行调理，一般可用水煎服葛根岑连汤等，也可服用绿梅止泄颗粒一类中成药，或者是选择口服益生菌类和止泻药物来治，同时，最好是多吃茯苓大米粥和山药莲子粥等可以起到食疗作用的食物。

慢性腹泻的主要危害之一是会导致肠道菌群失调，可诱发真菌性肠炎、肠出血等多种大肠疾病，严重时可能会导致肠穿孔。同时会因为长期性腹泻而出现免疫力下降的情况，且会因此而发生继发性感染。除此之外，还会引起营养不良和肝肾功能异常。

慢性腹泻会引发的并发症之一就是感染，除了一般的感染之外，还包括真菌感染，甚至是全身性的真菌病。再就是会出现营养不良以及维生素缺乏症，这也是慢性腹泻常见的并发症之一。除此以外，慢性腹泻的并发症还包括病毒性心肌炎以及中毒性肝炎。

如果慢性腹泻的病情比较严重，大便过于频繁，可以适当的应用止血药物进行治疗，常用的就是蒙脱石散。再就是可以使用微生物制剂来调理肠胃，改善肠道微生态环境。如果存在细菌感染的情况，可根据具体的致病菌选择合适的抗生素类药物，若腹痛严重，则需要应用解痉止痛的药物。

如果患上了慢性腹泻，可以根据病情选择合适的药物来治疗，比较常用的药物就是止泻药、肠道微生态制剂以及生长抑素及其类似物。慢性腹泻还需要根据病因进行相应的治疗，比如乳糖不耐受要避免食用乳制品，除此以外，对症支持治疗也是很重要的。