质子治疗和离子治疗都各有千秋。质子治疗精确度极准，副作用极小，治愈率极高。可以对肿瘤部位实现“定点定向爆破”，对肿瘤两侧和后面的组织基本没有副作用，不影响身体的其他健康组织。离子束治疗的优点是：
1.可对深部肿瘤进行治疗。它的能量到达靶点后，能量达到最大值，即布拉格峰，此后粒子能量急速下降，又能有效地保护肿瘤周围的健康组织。
2.粒子能量既能在电场中被加速，还能在磁场中被偏移，因此可以获得最佳治疗能量，定位精度可达到毫米级。