本军团菌肺炎在早期的时候会表现在消化道方便，大部分的患者有腹痛的情况，而且是水样的大便，另外神经症状也比较常见，比如焦虑、神经迟钝、谵妄。随着肺部病变进展，重者可发生呼吸衰竭。典型患者常为亚急性起病，疲乏、无力、肌痛、畏寒、发热等；亦可经2～10天潜伏期后急骤起病，高热、寒战、头痛、胸痛，进而咳嗽加剧，咳黏痰带少量血丝或血痰。痰量少，但一般不呈脓性。