发烧39度，单纯靠物理降温效果不太好，还是吃药比较好。出现39度，这种情况考虑是由于炎症感染引起的典型表现，这种情况需要积极的，到医院进行药物治疗，用一些消炎的药物来治疗，才能够达到很好的治疗效果，同时需要化验血常规检查。可以给宝宝酒精稀释后擦拭腋下、太阳穴、腹股沟处等；还可以用冷毛巾覆于额头。