甲硝唑主要用于肠外阿米巴病的治疗，对厌氧感染的治疗也可以用。对于牙痛牙周炎通常是由厌氧菌感染所导致，因此服用甲硝唑对治疗牙痛效果比较明显。通常甲硝唑片每片0.2克，如果用于厌氧菌治疗，可每次两片，每天三次，可用1到2个疗程，每个疗程7到10天。但服用甲硝唑也有一些副作用，包括消化道不良反应症如恶心、呕吐、食欲不振，腹部疼痛等；神经系统症状如头痛、眩晕、多发性神经炎等。