在治疗肛瘘的时候，可以采用外用药，但首先要保证局部的清洁卫生，所以建议用高锰酸钾坐浴，然后再涂抹金黄膏或者涂抹红霉素软膏。如果还伴有痔疮的话，可以涂抹痔疮膏，等到脓肿消散之后，再考虑是不是需要做手术治疗。除了局部用药之外，也需要口服消炎药。