慢性腹泻可以通过西药治疗，也可以通过中药治疗，另外食疗也是可以缓解病情的，不同的人群治疗腹泻的方法不一样，如果是小孩子出现了腹泻，最好通过食物进行调理，因为毕竟是药三分毒，孩子正在处于长身体的阶段，能不吃药最好不要吃。

如果出现了原因不明的腹痛、腹胀、消瘦、贫血等等，这样的症状我们就考虑给他做肠镜。同时也包括了一些肠道的症状，例如，便血、腹泻、粘液便，或者便秘等等。做肠镜的目的，就是翻开看患者的结肠，也就是说，从阑尾到直肠这一段大概1.5到2米的范围有没有病变。这些病变可能包括了炎症肿瘤溃疡等等。

小儿慢性腹泻的病程一般会持续两个月左右，还有的患儿可能不会持续性的腹泻，但每次发作间隔时间都在两到四周不等。患儿每次病情发作时，都会表现为大便次数增加、大便性状稀薄，且伴随有腹痛、肚脐胀痛的症状。而导致慢性腹泻病程延长的原因，主要是原发病未能及时控制有关。

慢性腹泻可以对症服用中成制剂治疗，若是与湿热下注病症有关，可以服用葛根岑连丸。脾肾阳虚者可以选择服用四神丸，在存在有脾肾虚寒一类病灶时则可以改用泻痢固肠丸。除此之外，还可以服用参苓白术丸、调脾止泻丸以及枳实导滞丸一类中成制剂。文中药物仅供参考，需遵医嘱谨慎用药。

慢性腹泻的常见并发症为营养不良和维生素缺乏症，与长期性大便次数增多和营养流失有关。同时会导致抵抗力下降，而出现真菌性肠炎一类继发性感染疾病。部分患者可能会并发中毒性肝炎，还可有电解质紊乱及肠出血的可能性，严重时会导致肾衰竭。