骨髓移植也可被认为造血干细胞移植，造血干细胞储存在骨髓中，所以也被称为骨髓移植。方法是首先进行大剂量放化疗、免疫抑制治疗，清除肿瘤细胞，然后将自体或异体造血干细胞移植到受体上，使受体重建正常的造血和免疫，从而达到治疗目的。常用于血液系统疾病如再生障碍性贫血，淋巴瘤，骨髓瘤等。