治疗卵巢囊肿吃的药物不同，医生通常会根据囊肿的性质决定药物，如果在检查出的时候，发现囊肿属于内膜样，通常要采取口服避孕药的方式治疗，如果是炎症性囊肿，可以使用抗生素或者活血化瘀的药物治疗。如果在检查时发现囊肿的体积较大，直径在5厘米以上，就需采取手术治疗。