三个月大的婴儿发烧时尽量不要用药，因为太小了。如果体温较高，可选择物理降温措施降低体温，采取温水擦拭宝宝足心、背部等易散热部位，可在腋窝等部位停留时间较长，避免在心前区、腹部等较受冷刺激停留时间过长，室温保持适宜等。如果体温过高，需要选择专门的婴儿退烧药服用。