喉咙肿痛为临床症状，多发于急性咽炎、急性会厌或疱疹性咽峡炎等疾病。多数疱疹性咽峡炎是由带状疱疹病毒感染引起的。大部分急性咽炎是上呼吸道感染后感染的病毒，例如鼻病毒、腺病毒等；若是急性化脓性扁桃体炎，多为上呼吸道感染，继发病毒或细菌感染后，甚至无氧感染，如扁桃体脓肿，也可能是病毒和细菌混合感染。