导致小儿发生慢性腹泻的原因主要是因为肠道菌群失衡，因为新生儿菌群尚未形成，如果在受到细菌、病菌和真菌等多种致病菌感染后，滥用抗生素的话，就容易引起慢性腹泻。另外，长期营养不良、乳糖不耐受和喂养不当的话，也容易造成小儿出现慢性腹泻的情况。

当出现慢性腹泻时，首先会有大便异常表现，比如大便次数增多、大便性状改变等；其次还会引起全身不适症状，比如腹部疼痛、恶心呕吐、脱水、身体消瘦等；病情严重时可能会诱发消化性溃疡，治疗不及时有可能会导致消化道出血、胃穿孔等。

慢性腹泻在中医上被分为多个证型，其中分为寒湿泄泻型、水饮留肠型、湿热泄泻型和瘀阻肠络型等等，建议可以服用平胃散、苓桂术甘汤合己椒苈黄丸加减、葛根芩连汤加减和少腹逐瘀汤加减等药方。这些药方对治疗慢性腹泻都有一定的效果，除此之外，还可以针灸天枢穴、足三里穴等部位，这样能够改善症状。

慢性腹泻的发病和某些全身性的疾病有着密切的关系，比较常见的就是糖尿病，部分患者是因为甲状腺功能亢进所致。某些胃肠道疾病也容易引起慢性腹泻，比如说溃疡性结肠炎，再就是患有大肠癌，还有部分患者是因为患有克隆病，也就是节段性肠炎。

小儿的消化系统发育还不是特别的成熟，肠胃功能比较差，如果饮食不当可能会导致慢性腹泻；细菌或病毒感染、着凉、不注意卫生、有乳糖不耐受问题时，也常会有慢性腹泻出现。细菌或病毒感染、着凉等引起肠炎时，还常会伴随着发烧症状。