六神丸和莲花清温的区别是比较大的，这两种药物作用于不同的情况，首先六神丸主要适用于治疗咽喉疼痛、咽喉发炎的患者，大概一天可以服用三次，但莲花清瘟主要是清瘟解毒，有一定的抗菌消炎的作用，这两种药物的组成也是有区别的，建议患者根据自己的情况来选择药物。