上颌窦囊肿手术疼不疼，跟手术的方式是有关系，如果选择局部麻醉手术，在手术的过程当中可能会出现疼痛的现象，但如果患者选择的是全麻手术，一般是没有任何的感觉。如果患者是一侧的上颌窦囊肿，一般术后疼痛是比较小，但如果是双侧的囊肿，手术的过程当中出血比较多，手术之后天灾会比较多，也可能会引起头痛以及牙齿头痛等现象，而这种情况一般会持续2~3天左右就会缓解。