双侧卵巢囊肿严不严重需要根据囊肿的性质综合判断，如果是良性囊肿，例如黏液性囊腺瘤、浆液性囊腺瘤等，并不是特别严重，通过手术治疗后，预后的效果非常好，如果是交界性卵巢囊肿，比如交界性黏液性囊腺瘤、交界性浆液性囊腺瘤，这种是比较严重。同时也有生理性囊肿，又称为黄体囊肿，主要是由卵泡释放的成熟卵子后形成的黄体激素紊乱，可形成黄体囊肿，一般是会自行消失。