任何手术都会有一定的风险，相对而言肺囊肿是一种相对成熟的手术，其风险较低，还取决于囊肿的大小、位置和感染程度来确定，如果是未感染的囊肿，只做单纯的囊肿摘除是可以的，风险很小。对于严重感染的囊肿，局部或全肺切除有时可能是必要的，风险略高。但治疗肺囊肿必须通过手术，若使用药物不一定有效，手术切除是治愈恶性疾病的最好方法。