这是两种不同性质的疾病，疼痛、便秘是肛裂的典型症状，而肛瘘的症状是流脓。肛瘘会导致瘙痒，肛瘘感染发炎，脓水淋漓不断，往往肛门周围潮湿发痒，甚至由于分泌物长期刺激，发生肛门周围湿疹，有湿疹合并感染，使病情加重。肛瘘外突然疼痛，多为感染发炎，或脓液引流不畅，但也预示着病势扩散，或有新的病灶发生。疼痛的程度与病势成正比疼痛越剧烈病势越严重。