二甲双胍比较多见的副作用有：反胃还有腹泻、呕吐、恶心、胃胀、腹部不适。除了胃肠道反应外，还常见有乏力及头痛。对绝大多数患者来说，二甲双胍的副作用常发作在药物治疗的早期，大约10周之内的时间。然后随着治疗的持续，绝大多数患者可以耐受，上述不良反应会逐渐消失。