骨样骨瘤的病程是有特征性的，病人在早期患病时会出现疼痛，且患病初期为间歇性的疼痛，在夜间时疼痛会加重，服用止痛药可以减轻。后期疼痛会加重，且具有持续性，任何药物都不能缓解疼痛，疼痛多数为局部的，软组织可能肿胀，但是受累区很少。