婴儿耳朵畸形一方面可能是遗传性因素所致，但是婴儿耳朵畸形一般属于隔代遗传。另一方面可能是准妈妈在怀孕早期不慎服用某些药物或者是过早的接触一些放射性的物质所致。此外，女性在怀孕期间受到病毒感染也会增加婴儿在出生之后患有耳朵畸形的几率。