1.不孕：卵巢囊肿会影响卵巢功能，并有可能导致输卵管不通，这些因素都会影响怀孕。有研究数据表明患卵巢囊肿的女性不孕的几率可高达百分之四十。
2.流产或早产：如果卵巢囊肿比较大，有可能会挤压子宫而影响子宫的增长，导致流产或早产。
3.难产：卵巢囊肿如果过大，有可能会挤压子宫及胎儿，使胎位异常，影响正常分娩。还有可能阻碍产道，导致难产。
4.对胎儿的影响：卵巢囊肿本身不会对胎儿有什么不利影响，但如果囊肿导致并发症，急需手术，或发现囊肿为恶性，急需治疗，就会对胎儿产生影响，甚至有可能因此而不得不放弃胎儿。