子宫内膜异位症大多数不能自然痊愈，但是有时如果是子宫内膜异位病灶比较小的病人，如果经历了一段时间的怀孕和哺乳，也就是大概一到两年的时间，如果没有月经来潮，没有大量的激素对于子宫内膜异位病灶的刺激，有可能较小的子宫内膜异位病灶会逐渐的吸收、萎缩，自然痊愈。对于有子宫内膜异位症的病人，建议如果女性还没有生育，尽快的生育是对于子宫内膜异位症的一个自然的治疗方法。因为怀孕和哺乳期间卵巢分泌的激素受到一定的抑制，而没有来月经，子宫内膜异位病灶也不会出现周期性的受刺激增长的现象，所以一些比较小的子宫内膜异位病灶，会逐渐的吸收并且自然痊愈。

子宫内膜异位症手术以后是有可能会复发的。由于子宫内膜异位症与卵巢分泌的雌激素的刺激有一定关系。对于生育年龄的女性，由于卵巢分泌的雌激素水平较为旺盛，子宫内膜异位症在治疗以后，有可能会再次复发。子宫内膜异位症包括有卵巢子宫内膜异位囊肿、深部结节性的子宫内膜异位症等等的表现形式。大多数由于卵巢囊肿进行手术，也就是巧克力囊肿剥除术，一般通过腹腔镜下的巧克力囊肿剥除，可以将卵巢的内膜异位囊肿得到治疗，但是在手术以后大约半年左右，就有可能出现卵巢巧克力囊肿的再次复发，因此在术后要给予GnRHa来进行预防复发的治疗，一般治疗疗程在三个月到半年左右。

子宫内膜异位的原因目前并不是很明确，但是通过临床病历的搜集还有观察，目前也出现了以下的这么几种学说。其中一个是子宫内膜的种植学说，考虑子宫内膜是通过经血的逆流，通过输卵管，可以种植在腹腔的一些部位，然后患者就会出现盆腔不同部位的疼痛。还有一个学说是免疫炎症学说，这个就是考虑患者免疫系统出现了障碍，但是具体的机制还不是很明确。还有一个就是上皮来源的这些组织发生了化生。可能是说长在腹腔里的某个部位的上皮组织，化生成了子宫内膜样的组织，这样随着卵巢周期的变化，子宫内膜也会出现一个周期性的变化。还有一部分患者是遗传的因素造成的，因为在临床上有可能会发现子宫内膜异位的患者，家庭经常有兄弟姐妹也会出现这种同一相似的病症。

子宫内膜异位症与高雌激素的环境有关。孕期、绝经后雌激素水平下降，异位灶就会萎缩。药物治疗的目的就是达到闭经的状态，使病灶萎缩。但是太大的病灶有可能不能完全萎缩，达不到自愈目的，如果是快绝经的女性，就不一定需要手术了。

巧克力囊肿是子宫内膜异位症，由于子宫内膜异位症的病灶移植到卵巢上，形成类似巧克力状的囊肿，所以叫巧克力囊肿。一旦确诊，建议做腔镜手术，是比较理想的治疗方法。还可以采取剥除术和一侧卵巢切除术，剥除术没有损伤，一侧卵巢切除术损伤一侧卵巢功能。