卵巢囊肿如果是生理性的囊肿它会自己消失的，而有一些卵巢上的肿瘤它是不会自己消失的，所以能否消失需要查看卵巢囊肿的性质。如果卵巢囊肿的直径大于六厘米持续三个月还没有消失，这种情况下建议进行手术治疗。同时切除的组织标本一定要进行病理检查，以判定卵巢的肿瘤具体的良恶性，因为卵巢肿瘤分类比较多，一定要积极的进行治疗。另外一定要定期的进行复查，来查看囊肿的大小以及增长的速度。如果月经前特别大而来月经后囊肿会变小可以暂时的观察，如果没有其他的症状卵巢囊肿，可能会受到女性月经周期、雌孕激素水平的调节，它会慢慢的消失这是一种生理性的囊肿。

大多数的卵巢囊肿是不会癌变，卵巢的生理性囊肿，一般在月经过后会自行消失，不需要进行处理，也不会发生癌变。子宫内膜异位症导致的巧克力囊肿是由于异位的子宫内膜组织种植和侵犯到卵巢组织形成的病理性囊肿。可能会形成浆液性囊腺癌等，但几率比较低。如果巧克力囊肿患者发现囊肿突然的迅速地长大等异常，要及时进行超声检查以及肿瘤标记物的检查，肿瘤标记物CA125，判断是否有恶变。卵巢的上皮性肿瘤也有可能发生恶变，要密切的观察，通过妇科检查、超声检查和肿瘤标记物的辅助检查，密切随访，及时发现恶变。

肿瘤性卵巢囊肿一般是细胞基因发生变化后产生的，卵泡囊肿以及黄体囊肿一般是卵泡、黄体没有及时萎缩导致的，卵巢巧克力囊肿与家族遗传体质、腹腔压力大等因素有关系。卵巢囊肿大体分为肿瘤性的和非肿瘤性两大类型，肿瘤性卵巢囊肿一般包括浆液性囊腺瘤、粘液性囊腺瘤、畸胎瘤等，这种肿瘤性卵巢囊肿没有明确原因，一般是细胞基因发生变化后产生。卵巢囊肿还有非肿瘤性的，比如卵泡囊肿、黄体囊肿，这些囊肿一般是卵泡、黄体没有及时萎缩导致的，可在来过几次月经后自然萎缩、消退。有时慢性盆腔炎、炎性包块也表现为卵巢囊肿，囊肿边界不清、囊壁很薄，一般可长期随诊观察。卵巢巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种类型，是经血逆流进入卵巢后，子宫内膜碎片在卵巢“扎根"生长形成的，而出现这种情况与家族遗传体质、腹腔压力大等因素有关系。

卵巢囊肿如果是生理性的囊肿，它会自然的消退，当然就不需要做任何治疗，如果是病理性的囊肿，是病态而长出的卵巢囊肿，那是必须要做治疗，是不可能自行消退的。卵巢囊肿患者要到医院去积极做检查，首先确定卵巢囊肿的大小，要排除是生理性的囊肿还是病理性的囊肿。

卵巢囊肿一旦被检查发现，首先要听医生的建议，是生理性的还是病理性的。一旦除外了生理性的，说你是病理性的。一般来讲，只要卵巢囊肿长到五厘米以上（指直径），就需要做手术治疗了。但是也有例外，比如说卵巢上发现了直径两厘米的，但是是实性肿物，或者是囊肿里边伴有乳头，这样多半是需要经过B超和临床检查来确定的。只要医生说你囊肿是病理性的可能大，那建议你还是要积极做治疗。一般来讲是以五厘米为界，只要超过五厘米以上，建议你还是要积极的去做手术治疗，将囊肿拿掉以维护你的身体健康。