神经系统损害、精神损害、心理损害、行为损害是癫痫对身体的主要伤害。
癫痫病不管是原发的还是继发的，的发作对身体多脏器多系统都可以造成伤害。癫痫病人长期治疗过程中效果不好，可能产生人格的改变等，造成很严重的智力、认知、运动行为等损害，所以癫痫患者预后并不很理想。相当一部分患者是一个终身治疗，终身的观察。治疗效果不好的患者会造成非常严重的身心损害。还会有对神经系统、精神系统、心理的损害。
癫痫患者往往可以影响心率、影响心肌，可以引起消化道的饮食方面的损害，也可以引起内分泌方面的肾上腺素的分泌、激素的分泌，产生各种各样的损害。癫痫病的时间越久，治疗效果不好，控制的不理想，对身心的损害就更严重，往往会产生除癫痫以外，还有合并症比如心血管、内分泌、消化系统等各种各样的障碍，精神运动系统的障碍就更严重。
癫痫对身体的损害是一个综合性的损害，多脏器的多系统的损害。