急性中耳炎一般可以选择的药物以广谱的青霉素和氨苄西林，在头孢菌素中可以用一代头孢菌素，头孢拉定、头孢唑林或者二代的头孢菌素，比如头孢呋辛等。
急性中耳炎的治疗原则是以抗感染、通畅引流和去除病因为主。首先是全身治疗，应该尽早使用足量的抗菌药物，来控制感染，务求彻底治愈，以防出现并发症或者转为慢性。
使用抗生素注意要一直用到症状完全消失，最好在症状消失后，还能维持数日来巩固抗感染效果。还有一类药物就是鼻腔的减充血剂或者鼻喷的减充血剂，可以减轻鼻咽部的黏膜肿胀，尤其是咽鼓管口周围黏膜肿胀，有利于咽鼓管功能的恢复，促进咽鼓管引流。除全身用抗生素之外，局部还可以用一些抗生素的滴耳剂，最常用的就是氧氟沙星滴耳剂，经外耳道滴入鼓膜，形成局部的抗感染作用。滴耳剂使用的时候，要采用耳浴的方式。