睁眼昏迷主要与昏迷、闭锁综合征以及脑死亡等疾病相鉴别。睁眼昏迷又叫持续植物状态，患者貌似清醒实质没有意识，有睡眠周期，但只有眼球能运动，其他所有活动都无法进行，也失去所有感觉，仅能遵从简单指令做眼球的运动和睁眼闭眼。昏迷表现为意识、运动、感觉的完全丧失，对外界刺激无反应，只有呼吸和心跳等基本生命体征。
闭锁综合征与睁眼昏迷主要的区别主要意，闭锁综合征的患者识清醒，能理解复杂对话，眼球仅能做上下的运动而左右运动受限，其他活动均无法进行。脑死亡与睁眼昏迷的区别在于有无脑干反射，脑死亡者无法维持自主呼吸和心跳，是严格意义上的真正的医学死亡。