它的处理方法主要取决于囊肿的类型、大小、部位以及是否引起症状。有一类脑袋里的囊肿，实际上是不会引起任何症状的。比如体积比较小的松果体区的囊肿、颞极的蛛网膜囊肿，特别是一些比较小的情况，还有枕大池的蛛网膜囊肿，这三类囊肿，通常都是由于先天性的病因造成的，如果在临床观察过程中，体积保持稳定，也没有引起任何的临床症状，只需要进行临床随访观察即可，而无需进行过多的干预和治疗。另外一类囊肿，是随着时间的推移会逐渐增大，并且引起患者的症状。比如体积比较大的鞍区Rathke囊肿、后颅窝桥小脑角的表皮样囊肿等囊肿类型。这类囊肿虽然也属于先天性的疾病，但是随着时间的推移，囊肿会逐渐增大，需要进行神经外科手术治疗。

蛛网膜囊肿自愈性不大，没有症状，没有痛苦的可以不做积极的处理，有了占位效应，一定要积极的治疗。蛛网膜囊肿原则上有两种，有一种比较小，不在重要的位置上，没有症状，没有体征，往往是在影像学检查中无意发现的，这样的囊肿可以不做临床上的积极处理，也不会自己消失，可能是在一个静止的状态不会增长，也不会有什么大的影响。另外一种蛛网膜囊肿可能长在一个重要的位置上，不断的长大的过程中，有了占位效应，临床上有所症状有所体征，就应该积极的进行治疗，包括穿刺、抽吸、开颅手术根治疗法等，所以蛛网膜囊肿自己消失的可能性不大，往往没有症状，没有体征的时候不被注意，可能就误会是自己消失了，实际上不一定。蛛网膜囊肿原则上可以不长，可以终止生长，没有临床上的症状和体征，没有什么痛苦，不做积极的处理，不等于自己会消失。

蛛网膜囊肿是一个先天性的脑内肿块，一般来说并不需要处理，它的发展是非常缓慢的，可能过几年甚至几十年都不一定大得起来。除非是发现囊肿进展得非常巨大，直径超过五个公分，对脑子产生明显的压迫，才可能考虑需要做手术。蛛网膜囊肿手术是一个比较常规的开颅手术。一般来说，幕上开颅手术的常规费用大概是三万五千元左右。但是很多蛛网膜囊肿都是需要进行判断分析的，主要要看它是什么类型的以及是否对脑组织构成占位、是否是进展性的，这些都要进行具体的分析。所以总费用还不是很贵，手术时间也很短，是手术过程中整个手术也就是半个小时就结束，除了麻醉以外，然后手术麻醉费用也少一点，术后的话，因为现在比较成熟，但这是囊肿的方法并不是做分流手术主要是做造瘘手术。

颞极蛛网膜囊肿是在颅内的颞叶前端，蛛网膜形成的包裹性的积液，本质上是蛛网膜包裹脑脊液形成的一种非肿瘤性的囊性病变，是成人及儿童中发生率较高的蛛网膜囊肿之一，是颅脑发育过程中蛛网膜发育异常导致的结构异常，不属于增生性病变，一般无需特殊处理，定期复查、观察患者症状情况即可。如出现明显临床症状，一般需采取手术切除。可以是先天性的原发性因素，也可以是后天性因素所致，先天性因素主要是胚胎时脑脊液的异常积聚加之蛛网膜下腔发育异常形成的。而后天性可以是各种原因引起的颅内出血、颅内感染或者颅内损伤造成蛛网膜粘连形成的，需要在神经外科进行评估，考虑是否需要手术治疗以免引起症状。

颅内囊肿的症状有小儿颅骨发育异常或巨颅畸形小儿，小儿期鞍上池囊肿可表现为抬头低头头部活动，即玩偶头样症状，左侧中颅凹囊肿可合并注意力不集中症，头痛，癫痫，脑积水，颅内压增高，发育迟缓，行为改变，恶心，偏瘫，肌肉运动不协调，幻听，早老性痴呆。老年患者(>65岁)症状表现为痴呆、尿失禁、偏瘫、头痛、癫痫。幕上囊肿可类似美尼尔氏病症状；额叶囊肿可出现抑郁；左颞叶囊肿可有精神症状。左额颞叶囊肿更多地表现为表情障碍；右侧裂区囊肿可导致在61岁左右出现新发精神分裂症；左中颅凹囊肿可有幻听、偏头痛和发作性幻想。