系统性红斑狼疮的治疗根据疾病的严重程度决定。系统性红斑狼疮是一个表现多种多样的疾病，可以有很轻的情况，也可能有非常重甚至是危及到生命的情况，不同情况的治疗方法和治疗原则不一样。
对于较轻的情况，可能只需对症治疗，如只有一些皮疹或关节疼痛，可能需要服一些止疼药或对皮疹有效的药物，有时可能外用药就能解决。
有的脏器受累，比如有血液系统的受累，有贫血、血小板减少的情况，或者有肾脏的受累，蛋白尿、肾功能不全等，这时要使用激素。如果这些脏器的受累情况较严重，还要使用大剂量的激素。若受累的脏器威胁到生命，还要使用冲击剂量的激素。
大剂量的激素一般是10~12片，冲击剂量的激素折合成片数得是20片左右，20到100片剂量，有的甚至还要折合到200片的剂量，所以它的治疗不一而足。还要使用一些免疫抑制剂，也是根据受累的情况决定。免疫抑制剂的种类很多，但更重要的一个药物是硫酸羟氯喹，不管病情严重还是轻，如果没有禁忌，都应该使用硫酸羟氯喹。这对于改善病情和防治病疾复发都非常重要。