病理性的眼皮跳动可由眼睛屈光不正，（近视，远视，散光等）眼内异物，倒睫、结膜炎、角膜炎等导致，发作较频繁、持续时间长、跳动幅度大，有人会连眉毛、额头、嘴角甚至半边脸都一起抽动。尤其面部肌肉痉挛后引起的眼皮跳动，99％是因支配眼皮肌肉运动的面部神经被颅内异常血管压迫刺激，1％为颅内肿瘤，蛛网膜粘连刺激面神经所致，因此也被视为颅脑内疾病的征兆。