万古霉素经常会用于改善细菌感染所带来的症状，服用这个药物比较常见的副作用就是会出现口腔异味，另外也会有嘴中发苦的情况。也有可能是其它令人不愉快的味道。这种情况通常出现在早上醒来后，或嘴巴里没有食物或液体的其它时候。万古霉素的副作用还包括过敏反应，症状包括皮疹，荨麻疹和鳞状皮肤等。