肛门镜和肠镜是肛肠病常用的检查工具。肛门镜片是对肛门病变的特殊检查，长度约10cm左右，最多可达到直肠，适宜该检查的疾病有痔疮、直肠息肉、肛门脓肿等。肠镜长度约100cm，经肛门进入肠道检查或取病理组织活检，查看的部位较肛门镜多，包括贲门、直肠、结肠，最多可达到回肠末端，适宜该检查的疾病有高度结肠肿瘤、溃疡性结肠炎，克罗恩病等。