多系统萎缩晚期会出现自主神经功能障碍，包括体位性低血压、排便障碍、胸闷心悸、异常出汗等症状。多系统萎缩会出现两种类型，一种主要是小脑性共济失调，走路不稳、说话含糊不清、手协调性差，称为多系统小脑萎缩型。还有一种多系统萎缩的P型即帕金森氏症症状较严重，主要表现为肢体僵硬、行走困难，很容易被诊断为帕金森氏症并接受治疗，但是治疗帕金森病的药物效果很差。