宝宝慢性腹泻的治疗方法有多种，首先需要使用对症治疗，其中包括预防脱水和平衡营养，出现脱水的情况就要补充液体。除此之外，还可以使用中医疗法，其中包括中医推拿和中药敷贴，在治疗的过程中需要做好护理工作，维持自身的营养，一旦出现不良反应，就要及时纠正。

慢性腹泻会引发的并发症之一就是感染，除了一般的感染之外，还包括真菌感染，甚至是全身性的真菌病。再就是会出现营养不良以及维生素缺乏症，这也是慢性腹泻常见的并发症之一。除此以外，慢性腹泻的并发症还包括病毒性心肌炎以及中毒性肝炎。

当出现慢性腹泻时，首先会有大便异常表现，比如大便次数增多、大便性状改变等；其次还会引起全身不适症状，比如腹部疼痛、恶心呕吐、脱水、身体消瘦等；病情严重时可能会诱发消化性溃疡，治疗不及时有可能会导致消化道出血、胃穿孔等。

慢性腹泻的常见并发症为营养不良和维生素缺乏症，与长期性大便次数增多和营养流失有关。同时会导致抵抗力下降，而出现真菌性肠炎一类继发性感染疾病。部分患者可能会并发中毒性肝炎，还可有电解质紊乱及肠出血的可能性，严重时会导致肾衰竭。

慢性腹泻能否自愈，需要看病情的严重程度。如果只是饮食不当、着凉等原因引起的轻微腹泻，注意合理饮食、适度锻炼、保暖防寒等，可以实现自愈的目的；如果是细菌、病毒感染引起的慢性腹泻，症状严重时，需要及时治疗，很难自愈。