黄体酮是孕激素，一般黄体酮是比较天然的孕激素，所以如果长期不来月经，打黄体酮催经是没有什么坏处的。正常情况下女性在1个月经周期中，在月经期到排卵之前，体内的卵泡是逐渐增长，会分泌雌激素。在排卵之后，卵巢的颗粒细胞会转化成黄体细胞，黄体细胞会分泌雌激素和孕激素。孕激素就是可以作用在子宫内膜上，是增殖期的内膜，转化成分泌期的内膜。如果没有怀孕的话，黄体发展到一定程度，就会逐渐出现萎缩，使体内的雌孕激素水平下降，子宫内膜失去了雌孕激素水平的，维持而脱落、出血，表现为月经的来潮。
所以长期不来月经，有可能是由于没有排卵，使体内缺乏孕激素，所以给进行黄体酮的补充，可以使子宫内膜从增殖期的内膜，转化成分泌期内膜，让来一下月经是没什么坏处的。而且长期不来月经，也有可能会是造成子宫萎缩，子宫变小、子宫内膜变薄，或者也有长期单一的雌激素作用下，也可能会使子宫内膜过度增生，造成子宫内膜过厚，或者是甚至发生非典型增生，子宫内膜癌变所以长期不来月经。
如果子宫内膜比较厚，可以用黄体酮让子宫内膜转化一下，然后脱落、出血一下，实际上对子宫内膜也是保护现象。如果长期的单一雌激素作用下，很容易发生子宫内膜的癌变或者癌前病变。所以用黄体酮来使子宫内膜转化一下，脱落是对子宫内膜的一个保护，是没有什么坏处的。而且黄体酮注射液大多数，都是天然的黄体酮，所以相对来说副反应很小，用了之后一般不会有什么特殊的不适。
而且如果没有排卵，就起到补充的作用，如果是长期不来月经，实际上是怀孕了，没发现怀孕之前用了黄体酮的话，对胚胎也不会有什么坏处的。因为黄体酮是孕激素，可以抑制子宫收缩，可以从而起到保胎的作用，也可以促进胚胎的发育。所以在不知怀孕的情况下，用了黄体酮对胎儿是没有什么坏处的，还可以起到保胎的作用。