目前临床上对于卵巢囊肿可以分为生理性囊肿和病理性囊肿两大类。生理性囊肿是由于卵巢在排卵后形成的黄体囊肿，在妊娠后会出现妊娠的黄体或者是排卵前形成大的卵泡，卵泡有时不破裂可以生长到三到四厘米这叫做卵泡囊肿。生理性囊肿再来月经结束后会自行的消失，但是卵泡破裂排卵后可以进行超声检查发现卵巢囊肿消失。病理性的囊肿比如浆液性的囊腺瘤、粘液性囊腺瘤，以及卵巢子宫内膜异位囊肿，是不会随着月经结束而消失的，一般需要进行人为的干预将其手术治疗，所以对于生理性的卵巢囊肿，一般会随着月经消失，而病理性的卵巢囊肿，则不可能随着月经而消失。

并不是所有的卵巢囊肿都一定要做手术的。因为卵巢囊肿它主要分为生理性囊肿和病理性囊肿，生理性囊肿可能经过一段时间的复查之后，它可能就会消失了。病理性囊肿当中，我们又进一步分为非肿瘤性囊肿和肿瘤性囊肿。非肿瘤性囊肿最常见的就是子宫内膜异位囊肿，也是巧克力囊肿。除此之外还有像一些炎症性的囊肿，对于炎症性的囊肿，我们一般通常主要是靠消炎治疗，然后进行抗生素治疗之后，有可能囊肿就会消失。而对于子宫内膜异位囊肿，也是巧克力囊肿，对于一些比较小的没有明显症状的，这样的囊肿我们可以进行观察就可以了。对于肿瘤性囊肿，我们又可以分为良性的和恶性的。对于良性的囊肿，尤其是小的没有明显症状的这些良性囊肿，可以不进行手术治疗，只要观察就好了。当然如果是恶性的囊肿就一定要做手术了。我们通常最重要的是发现了卵巢囊肿之后，需要鉴别它到底是良性还是恶性的。我们就需要进行进一步的检查，这些检查包括B超、CT、核磁、还有肿瘤标志物的检查，通过这些检查来进行综合的判定，同时结合了有没有临床症状来判断，是不是要进行手术的治疗。

肿瘤性卵巢囊肿一般是细胞基因发生变化后产生的，卵泡囊肿以及黄体囊肿一般是卵泡、黄体没有及时萎缩导致的，卵巢巧克力囊肿与家族遗传体质、腹腔压力大等因素有关系。卵巢囊肿大体分为肿瘤性的和非肿瘤性两大类型，肿瘤性卵巢囊肿一般包括浆液性囊腺瘤、粘液性囊腺瘤、畸胎瘤等，这种肿瘤性卵巢囊肿没有明确原因，一般是细胞基因发生变化后产生。卵巢囊肿还有非肿瘤性的，比如卵泡囊肿、黄体囊肿，这些囊肿一般是卵泡、黄体没有及时萎缩导致的，可在来过几次月经后自然萎缩、消退。有时慢性盆腔炎、炎性包块也表现为卵巢囊肿，囊肿边界不清、囊壁很薄，一般可长期随诊观察。卵巢巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种类型，是经血逆流进入卵巢后，子宫内膜碎片在卵巢“扎根"生长形成的，而出现这种情况与家族遗传体质、腹腔压力大等因素有关系。

在怀孕的早期，有的孕妇到医院做B超检查的时候，可以发现卵巢上面有一个囊肿，这种情况大部分是黄体囊肿造成的。这是由于怀孕以后黄体继续分泌雌激素和孕激素，会导致囊肿的发生。这样的囊肿大多是单侧性的，而且它的直径小于五公分，壁比较薄，这种情况下可以继续妊娠。大部分人会在妊娠到三个月以后自行的消失。在怀孕的早期发现了这种情况，一般不需要特别的处理，只是这样的女性，这个时候一定要注意休息。因为卵巢囊肿如果比较大的情况下，会感觉到一侧小肚子的胀痛，腰酸这样的情况，再加上女性本身在怀孕的早期，也可能会出现偶尔头晕、恶心、呕吐这样的一些不良反应，所以这个时候一定要注意休息，减少活动，不要吃一些生冷辛辣和刺激性的食物。

卵巢囊肿的治疗首先应该判断这个囊肿是生理性的还是病理性的，生理性的囊肿不需要处理，病理性的囊肿也要看是良性的还是恶性的。这个要根据囊肿的大小、囊肿的内容物以及患者的症状来进行相应的处理。首先要判断是否病理性的囊肿，当直径超过了五公分以上，就应该进行干预。具体治疗方法可分为手术治疗，或者是药物治疗。手术治疗主要是把囊肿剥掉，或者是把囊肿抽吸掉。卵巢囊肿治疗是一个比较复杂的问题。如果进行囊肿的剥除，可以通过腹腔镜囊肿剥除，或者是开腹囊肿剥除，或者是经阴道进行囊肿的剥除。抽吸可以腹腔镜下囊肿抽吸，也可以超声引导下进行囊肿抽吸。根据囊肿的性质，再决定后续的要不要再进行药物治疗。有些把切掉以后，就可以定期的检查观察。但是有些剥掉囊肿以后还要后续的有药物治疗，比如卵巢的子宫内膜异位囊肿。总而言之，卵巢囊肿主要治疗方法是通过手术干预。这个手术可以是开腹的，腹腔镜的，也可以通过超声引导穿刺进行干预。