尖锐湿疣需要通过手术或药物治疗。
尖锐湿疣治疗分三步：
一、去除肉眼可见的疣体。
二、防止疣体的复发或处理疣体的复发。
三、尽可能的减少HPV病毒。
第一步去除疣体的方法很多，包括激光、微波、冷冻、电灼，还有外用的药物都可以帮着去除疣体。第二步防止疣体的复发，尖锐湿疣的复发率非常高，一旦复发，需再一次将疣体去除，直到疣体基本上不再生长为止，现在有治疗手段，包括光动力、外用的药物甚至局部注射的手段，都可以帮助尖锐湿疣的疣体，减少复发。第三步是尽可能地清除病毒，如果这个病毒没有完全清除，一方面在免疫力低下的情况下可以再复发湿疣，另外一方面，这个病毒在皮肤粘膜，尤其是在外生殖器的部位，本身有传染性。
去掉病毒的方法，其实和防止复发的方法大体上差不多，只是说时间用得更长，尽量去掉病毒，除光动力这些治疗手段以外，可以抹外用的药膏，像咪喹莫特、干扰素或其他能增强局部免疫力的药物。