肠胃炎根据患者的不同的病因和症状，在医生的指导下进行指导下治疗。
从病因学最常见的就是所谓的细菌性还有病毒性，细菌性的最常见的就包括沙门氏菌、弯曲菌、金黄色葡萄球菌以及大肠埃希氏菌属。通常是在食物搁的不洁净的房间之中。或者在冰箱中放的时间长了之后会引起细菌的滋生。如果不慎吃了这些食物之后就会出现恶心呕吐腹泻发烧脱水这些情况。针对细菌性的治疗，除了积极的口服补液盐或者是输液之外，可能还得需要给积极的抗生素的治疗，抗生素的治疗那患者症状比较轻，就是口服的头孢或者是喹诺酮类的药物治疗，但如果是胃肠道反应比较重，可能就得需要给积极的输液的抗生素的治疗。
病毒性的胃肠炎的治疗，最常见的就是在夏秋两季，是诺瓦克或者是轮状病毒这两个病毒在中国来说，夏秋两季是最常见，尤其是见于老人和儿童在患者机体免疫力比较低的情况之下，会引起病毒的治疗没有特异性地针对病毒的治疗，而针对患者的症状有一些治疗，比如恶心呕吐腹泻那可以给予胃黏膜保护剂，比如口服或者输液的法莫替丁，在脱水给积极的补充电解质的治疗再加上如果患者有腹泻再没有肠梗阻的情况下，可以给患者思密达等肠黏膜保护剂的治疗。